يكرّس مركز دراسات القدس في جامعة القدس جهوده لتأهيل جيل جديد من العلماء والباحثين القادرين على فهم الواقع المعقّد لمدينة القدس والتعامل معه. ومن خلال برنامج الماجستير متعدد التخصصات في دراسات القدس، يدمج المركز بين مجالات مثل التاريخ، القانون، الدراسات الحضرية، علم الآثار، والعلوم السياسية. ويعكس هذا النهج الحاجة إلى أدوات تحليلية شاملة لفهم الأوضاع السياسية والاقتصادية والاجتماعية والثقافية المتداخلة في المدينة. ومن خلال تعزيز البحث الأكاديمي وتشجيع الاستراتيجيات المبتكرة، يهدف المركز إلى تعميق الفهم لمدينة القدس والمساهمة في إنتاج دراسات علمية تعكس التحديات والخصوصية التي تتميز بها المدينة.