توفر الجامعة فرصة للتعليم العالي والخدمات المجتمعية في منطقة القدس وفي البلدات والقرى ومخيمات اللاجئين المجاورة لها في الضفة الغربية. تحتوي الجامعة على ستة عشر كلية أكاديمية موزعة على أربعة مواقع، وهي:كلية القدس – بارد، كلية الدعوة وأصول الدين، كلية العلوم التربوية، كلية الحقوق، كلية الصحة العامة، كلية الآداب، كلية طب الأسنان، كلية الطب البشري، كلية الهندسة، كلية الطب البشري، كلية القرآن والدراسات الإسلامية، كلية الأعمال والاقتصاد، كلية الدراسات الثنائية، كلية المهن الصحية، كلية الصيدلة وكلية العلوم والتكنولوجيا.